复旦大学附属肿瘤医院是国家卫生健康委员会预算管理单位，是教育部、国家卫生健康委员会、上海市人民政府共建托管单位，建院于1931年3月1日，是我国成立最早的，集医、教、研、防为一体的三级甲等肿瘤专科医院。
医院设有徐汇院区、浦东院区两个院区，并与上海市质子重离子医院（复旦大学附属肿瘤医院质子重离子中心）高度融合、共同发展。截至2021年底，医院实际开放床位2084张。教职员工2,882人，其中正副高级专家407人；博士生导师89人，硕士生导师99人。
医院有国家教育部重点学科2个（肿瘤学、病理学）、国家临床重点专科3个（肿瘤科、病理科、中西医结合科），卫生部临床重点学科3个（乳腺癌、放射治疗、病理学）、教育部创新团队1个（乳腺癌的基础和临床研究）、上海市临床医学中心3个（肿瘤学、肿瘤放射治疗、乳腺癌）、上海市重中之重临床医学中心1个（上海市恶性肿瘤临床医学中心）、上海市重中之重临床重点学科1个（胸外科）、上海卫生重点学科1个（病理学）、上海市临床重点专科项目5个（肿瘤学、病理学、放射治疗学、妇科肿瘤学、胸部肿瘤学），同时是上海市病理质控中心、放射治疗质控中心、肿瘤化疗质控中心的挂靠单位，也是上海市抗癌协会的支撑单位。设有国家药物临床试验机构，拥有上海市乳腺肿瘤重点实验室、上海市病理诊断临床医学研究中心、上海市分子影像探针工程技术研究中心、上海市肿瘤疾病人工智能工程技术研究中心、上海市胰腺肿瘤研究所和上海市泌尿肿瘤研究所，以及复旦大学肿瘤研究所、复旦大学病理研究所、复旦大学乳腺癌研究所、复旦大学胰腺癌研究所、复旦大学大肠癌诊治中心、复旦大学鼻咽癌诊治中心、复旦大学前列腺肿瘤诊治研究中心、复旦大学甲状腺肿瘤诊治研究中心、复旦大学附属肿瘤医院肺癌防治中心、复旦大学生物医学影像研究中心、复旦大学附属肿瘤医院恶性黑色素瘤防治中心、复旦大学胸部肿瘤研究所等科研机构，成立王红阳院士工作站，新建复旦大学附属肿瘤医院精准肿瘤中心，继续推进国家疑难病症诊治能力提升工程项目。主办《中国癌症杂志》、《肿瘤影像学》、英文版《Journal of Radiation _disibledevent="https://www.gongkaoleida.com/article/1214411">
